當然，年齡小對手術的耐受性是相應差一些，手術的危險性也大一些，但是如果心髒畸形復雜或病變嚴重，可導致血液循環紊亂，引起心肺功能損害。隨著年齡增大，心肺功能的受損也逐漸加重，即使以後心髒畸形可以通過得到糾治，但受損的心肺組織其功能已難以恢復，手術成功也達不到治愈的目的。有些重危病兒由於手術不及時而危及生命。所以，先心病手術的最佳時間應該根據患兒的具體病情而定。最常見的先心病動脈導管未閉、室間隔缺損、房間隔缺損，其手術時間要視缺損的大小而定，如缺損大，分流量大，肺充血嚴重，經常伴有心衰、肺炎等並症者，應及早手術、手術可在嬰兒期（1歲以內）進行。
對青紫型先心病，如法洛四聯症、肺靜脈異位引流等病情嚴重的患兒，如經常有缺氧發作的也應在嬰兒期手術。如病情不很嚴重，有青紫但不影響生活的可以在2歲後手術。對嚴重的心血管畸型，如大動脈錯位；永有動脈干、肺動脈閉等，應按病兒的不同情況，盡早爭取手術。
總之，得了先心病應到專科醫院徹底檢查，並由小兒心髒專科醫生根據病情確定最佳手術時間，對病情不太嚴重能夠正常生活的患兒，最好也能在學齡前予以手術，這樣可以不妨礙患兒入學後的生活和學習。當然，手術的最佳年齡還取決於手術的客觀條件，如醫療設施和醫生的技術水平等。一些設備先進、臨床經驗豐富、技術高超的專科醫院，對嬰幼兒心髒手術的治愈率較高，其效果是可喜的。
