與其他原因引起的各種心肌炎進行鑒別：
1.風濕性心肌炎 風濕性心肌炎常有扁桃體炎或咽峽炎等鏈球菌感染史，抗“O”增高，血沉降多明顯增快，C反應蛋白(CRP)陽性，心電圖改變以P-R間期延長較常見，咽拭物培養常有鏈球菌生長，且多有大關節炎，鑒於風濕性心肌炎常有心內膜炎，因此二尖瓣反流性收縮期雜音多較明顯，且可因瓣膜水腫、炎症出現舒張期雜音(Carey Coombs雜音)，若心髒擴大不明顯，而雜音較響亮，則風濕性可能性更大。傷寒性心肌炎雖有心肌炎的表現，但多有典型的傷寒病表現，心髒無舒張期雜音，心電圖可有ST-T改變、P-R間期延長及T波改變等，白細胞總數偏低，從血液、骨髓、糞、尿或玫瑰疹刮出液中培養出傷寒桿菌。注意從以上幾點進行鑒別。
2.β受體功能亢進綜合征 本征多見於年輕女性，常有一定精神因素為誘因，主訴多易變，而客觀體征較少，無發熱、血沉增高等炎症證據，主要表現為心電圖ST段、T波改變及窦性心動過速，口服普萘洛爾20～30mg後半小時即可使ST段、T波改變恢復正常;傷寒性心肌炎心電圖上有ST-T改變系心肌損害所致，口服普萘洛爾後短期內不能恢復正常。此外，β受體功能亢進綜合征無心髒擴大、心功能不全等器質性心髒病的證據。
3.原發性心肌病 可有家族史，病程長，進展緩慢，擴張型心肌病心髒常明顯擴大，可有動脈栓塞現象，病毒分離陰性，血清病毒中和抗體效價無短期內增高，心電圖常有各種心律失常，有時可見病理性Q波。傷寒性心肌炎多發生在傷寒病程第2～3周，同時多伴有嚴重的毒血症。傷寒性心肌炎的症狀、體征及心電圖改變一般隨病情好轉而恢復正常。
4.冠心病 本病與心肌炎一樣可累及心肌，造成心髒擴大，均可有心律不齊、心力衰竭等。冠心病多見於45歲以上的男人和絕經期後的女性，年齡大者更多見。冠心病往往有多種患病因素，如高脂血症、高血壓、糖尿病、肥胖少動、家族史等。而傷寒性心肌病多發於青少年和兒童，往往有典型的傷寒病症狀和體征。細菌培養找到傷寒桿菌等可供與該病進行鑒別。
