急性期以采用自由基清除劑如維生素C等治療為主，抗病毒治療為輔。慢性期主要是自身免疫性損害和心功能不全，故應以改善心功能為主，難治性者加用免疫抑制劑。
1.休息和飲食
應盡早臥床休息，急性期臥床不應少於3個月，至恢復期(即6～9個月)可過渡到下午半日臥床休息。有心髒增大者，臥床休息應延長至心胸比率接近正常後，再開始有計劃地活動。心力衰竭者應完全臥床。進易消化和富含蛋白質的食物。
2.抗感染治療
(1)、抗病毒治療：主要用於疾病的早期。
①、三氮唑核苷(利巴韋林，Ribavirin)：10～15mg/kg/d，分2次肌內注射或靜脈點滴。
②、干擾素：1.5～2.5萬U肌內注射，1次/d，5～10天為1個療程，隔2～3天後可重復1療程。
③、抗柯注射液：系從低毒而明顯抗柯薩奇B病毒的苦參中提取，現已制成純度為99.43%的抗柯注射液,能明顯改善症狀及體征。
(2)、抗菌治療：一般常規應用青霉素1～2周。慢性心肌炎時，應注意治療或清除細菌感染灶，如慢性扁桃體炎、慢性鼻窦炎、中耳炎等。
(3)、中藥：黃茋注射液40g靜滴，1次/d，共2周。牛磺酸2g/次，口服，3次/d，療程1～10個月。中草藥板蘭根、連翹、大青葉、虎仗、苦參等可能對病毒感染有效。
3.自由基清除劑
營養心肌急性心肌炎時應用自由基清除劑，包括靜脈或口服維生素C、服輔酶Q10、VitBco、ATP、肌苷、環化腺苷酸、細胞色素C、丹參等。
4.提高免疫功能
(1)、胸腺肽：10mg或0.1mg/kg，肌內注射1次/d，15～30次為1個療程。注射前先以10倍稀釋作皮膚試驗。完成療程後，作用可維持1～2年。
(2)、卡介苗：於前臂滴藥液處皮膚上劃痕1～1.5cm，兩劃，隔日1次；4周後改為每周2次，共30次。可維持作用1年左右。
(3)、丙種球蛋白：1次肌注2～5ml，維持療效3～4周。(4)轉移因子：1～3U/次皮下注射於上臂或大腿內側，每周1～2次，一月後改為每2周1次，共2個月。
5.糖皮質激素
糖皮質激素用於常規重症心力衰竭、心源性休克和緩慢性心律失常病人，療程不少於6個月，以10～12個月為好。應注意藥物的不良反應和繼發性感染。
6.對症治療
(1)、心源性休克：
24小時分4～6次靜脈注射大劑量VitC，總量可達30g/日。補液、糾正酸中毒。血壓仍不升高或升高不滿意者，應使用升壓藥維持血壓。使用洋地黃類改善泵功能，給予糖皮質激素，如吸氧，使用鎮靜劑等。
(2)、心力衰竭：
基本藥物為洋地黃及利尿劑，具體用藥方法及注意事項參見“心功能不全”。但病人對洋地黃的敏感性增高，易發生洋地黃中毒(常表現為心律失常)，故心肌炎病人只用常規劑量的2/3。使用利尿劑時，應注意補鉀；必要時聯合使用排鉀和保鉀性利尿劑。
(3)、緩慢性心律失常：
嚴重窦緩和高度房室傳導阻滯者應及時給予大劑量糖皮質激素，靜脈點滴異丙腎上腺素、阿托品或654-2、大劑量VitC，試用氨茶鹼(0.25～0.5g)、煙酰胺(600～1400mg)、心先安(60～90mg)靜脈點滴。多數患者在4周內恢復窦性心律和正常傳導。必要時安裝臨時或永久心髒起搏器。
(4)、快速性心律失常：
β阻滯劑和胺碘酮是首選的治療藥物。控制房顫心室率可選用β阻滯劑、洋地黃、地爾硫?或維拉帕米；若治療室上性或室性心動過速，可使用胺碘酮；必要時行電復律治療。嚴重危及生命的快速性心律失常，可給於糖皮質激素治療；必要時置入ICD。
7.ACEI、AngⅡ受體拮抗劑
早期應用可阻斷病毒心肌炎患者的心肌自身修復過程，加重病情發展。故急性期不能作為干預心肌纖維化的合適時機，干預最佳時期為慢性期。
