在心室水平產生左至右的分流，分流量多少取決於缺損大小。缺損大者，肺循環血流量明顯增多，流入左心房、室後，在心室水平通過缺損口又流入右心室，進入肺循環，因而左、右心室負荷增加，左、右心室增大，肺循環血流量增多導致肺動脈壓增加，右心室收縮期負荷也增加，最終進入阻塞性肺動脈高壓期，可出現雙向或右至左分流。
症狀
缺損小，可無症狀。缺損大者，症狀出現早且明顯，以致影響發育。有心悸氣喘、乏力和易肺部感染。嚴重時可發生心力衰竭。有明顯肺動脈高壓時，可出現紫绀，本病易罹患感染性心內膜炎。
體征
心尖搏動增強並向左下移位，心界向左下擴大，典型體征為胸骨左緣Ⅲ-Ⅳ肋間有4-5級粗糙收縮期雜音，向心前區傳導，伴收縮期細震顫。若分流量大時，心尖部可有功能性舒張期雜音。肺動脈瓣第二音亢進及分裂。嚴重的肺動脈高壓，肺動脈瓣區有相對性肺動脈瓣關閉不全的舒張期雜音，原間隔缺損的收縮期雜音可減弱或消失。
(一)、感染性心內膜炎
在1歲以下嬰兒很少見。Corone等的一組患者中，以15～29歲的發生率最高。一般說來，生存時間愈長，並發感染性心內膜炎的機會愈大。根據文獻統計，發生率達25%～40%。但從抗生素和化學療法廣泛應用以來發生率大為降低，約5～6%，低到2～3.7%。不過其患者年發生率仍為0.15%～0.3%。
(二)、主動脈瓣關閉不全
室間隔缺損位於右心室流出道和室上嵴下方者，容易伴有主動脈瓣關閉不全。Nodas報告發生率為4.6%，Tatsuno報告為8.2%。造成關閉不全的原因有二：
①、缺損位於主動脈瓣環的緊下方，瓣環缺乏足夠的支持。高速的分流自左向右噴射時，把主動脈瓣葉拉向下方，先使其延長，再產生脫垂，形成關閉不全。如不及時修補缺損，關閉不全將逐漸加重。
②、有些缺損邊緣變厚，機化收縮，甚至形成纖維帶，牽拉主動脈瓣，產生關閉不全。
(三)、傳導阻滯
膜部缺損邊緣的心內膜繼發性纖維化，壓迫鄰近傳導束，產生完全性或不完全性傳導阻滯。
膜部間隔——面積甚小，直徑小於1.0cm，三尖瓣隔葉從前上至後下附著於膜部，左室面觀察直接位於主動脈瓣下。此外可分為嵴下型(膜周部)室間隔缺損+隔瓣下型或房室通道型室間隔缺損+嵴上型或干上型室間隔缺損。
室間隔缺損很少單純累及膜部間隔，故稱為膜周部室間隔缺損，占70%-80%。左室面觀察，缺損上緣緊貼於主動脈瓣環下，在右冠瓣與無冠瓣結合部下方;右室面觀察，缺損位於室上嵴下方，三尖瓣隔瓣和前瓣聯合附近的室間隔上。左室呈囊袋狀向右室突出，稱為室間隔膜部瘤破裂，可形成罕見的左室右房通道。
肌部室間隔缺損——1大室間隔缺損缺損直徑>1/2主動脈瓣環直徑，對左向右分流無限制作用，稱為非限制型室間隔缺損。2中等大小的室間隔缺損。3小室間隔缺損。
