目前病毒性心肌炎尚無特效的治療方法，主要靠綜合治療措施。一般治療包括：
①飲食宜給富有維生素和蛋白質而易於消化的食物，應少食多餐，忌暴飲暴食，以免增加心髒的負荷;
②鎮靜吸氧對哭鬧，煩躁不安者應用鎮靜劑，有缺氧症狀者給予氧氣吸入。心肌細胞賦活類藥物的綜合治療，急性期可靜脈注射維生素C、二磷酸果糖。口服輔酶Q10，肌苷，維生素C，維生素E，VitBC0等。
③休息患心肌炎後心肌有彌漫性病變，尤其左心室，臥床休息可減輕心髒負荷，減少心肌耗氧量，有助於心肌內炎症的吸收，病變細胞得到修復。臥床休息時間視病情輕重而定，一般急性期休息2--3個月，病情好轉後逐漸增加活動，如果有心髒擴大或伴有心力衰竭，則應臥床休息到心髒縮小至正常大小，心功能恢復至正常穩定後，開始下床輕微活動，根據病情的恢復情況，漸漸增加活動。
④抗感染治療病毒性心肌炎要積極控制已有的感染，及避免再次受病毒或細菌感染，使病情加重。提高機體免疫能力，防止反復呼吸道感染，可選用胸腺肽，轉移因子，及中藥等藥物治療。病毒性心肌炎的發病以輕中型多見，重型較少，經長期隨診結果，絕大多數痊愈，少數遷延，極少數死亡。
影響預後的主要原因有以下：
(1)治療不夠及時輕型心肌炎早期，臨床症狀多較輕，僅心電圖有異常改變，X線及超聲心動圖結果異常的少見，不易被家長發現，臨床醫生也可能忽視而漏診，未能及時休息治療，致使病情拖延、加重，甚至已發展為慢性。失去治療的最佳時機。
(2)不重視休息，沒有堅持治療心肌炎的臨床表現常較實際病情為輕，使部分家長不重視，在住院治療好轉出院後或經門診治療一段時間後，不再繼續用藥，參加一切體育活動，使病情遷延或加重。
(3)反復感染患心肌炎後部分患兒機體免疫功能減低，特別是細胞免疫功能降低，易受細菌或病毒感染，可導致心肌炎加重及復發，故在心肌炎的病程中，應注意增強機體免疫力，如有感冒或其他感染，要采取積極治療措施。
(4)沒有堅持長期隨診定期門診隨診能對病情有系統觀察，得到醫生的指導，如有病情變化，及時調整治療方案。使病情順利恢復。
(5)與病情輕重有關，輕中型病例，經正規休息和治療，大多數能徹底恢復;重型病例因其病變廣泛、嚴重，發病較急，即使積極搶救，正規治療，病情易於遷延或留有後遺症，甚至死亡。
