1.衛生宣教堅持以防為主，向群眾宣傳本病的基礎心髒病、易患因素、發病機制、臨床表現及其危害性，勸告人們遠離毒品。對於有靜脈藥瘾者勸其積極戒毒，減少心髒感染性心內膜炎的重要途徑。對易患人群應進行有關本病的預防宣教，對已施行手術的先天性心髒病患者，若仍遺留有血流動力學改變，都必須注意預防。對持續存在的先天性心髒病以及獲得性心瓣膜病患者，應讓患者掌握有關預防本病的知識和抗生素的具體用法，同時，還應讓所有醫務人員熟悉高危患者預防的必要性和具體方法。
2.預防用藥由於本病的致殘率、病死率較高，因此，應積極采取有效的預防措施，而一級預防最為重要。因本病發病早期存在菌血症，所以，首先要從預防菌血症著手。許多學者研究發現，拔牙後常會發生暫時性菌血症，尤其是患有牙周病或同時拔除多只牙齒的情況下更是如此。許多口腔細菌可經創口入血，但以草綠色鏈球菌最多見。消化道和泌尿生殖系統創傷和感染常引起腸球菌和革蘭陰性桿菌菌血症。葡萄球菌菌血症見於皮膚和遠離心髒的感染。細菌進入血液循環後，並不一定發病，但它可能對原有基礎心髒病變的患者造成嚴重威脅。由於本病可發生在器質性心髒病變的基礎上，也可以由侵入性的手術操作引起，但是否發病與入侵病原微生物的種類、心瓣膜病變及其血流動力學改變、機體的免疫力等因素有關，所以，用抗生素預防本病既要積極，也要避免濫用。
