本病的臨床表現取決於患者的年齡、性別、感染病毒的類型、機體反應性以及病變范圍等因素，輕重差異很大，且不特異，易造成誤診或漏診。病毒性心肌炎的診斷必須建立在有心肌炎的證據和病毒感染的證據基礎上。病情輕重懸殊，自覺症狀較檢查所見為輕。多數在出現心髒症狀前數日或3周內有上感或其他病毒疾患。輕者幾無症狀而呈亞臨床經過，或症狀輕微；重者可出現心髒擴大、心功能不全、嚴重心律失常、休克等，甚至猝死。
病毒感染史50%～80%的患者有過發熱、倦怠、全身肌肉酸痛、流涕等上呼吸道感染引起的“感冒”樣症狀或惡心、嘔吐、腹瀉等消化道症狀；部分患者因症狀輕微而忽略，此時雖無明顯的前驅症狀，但並不能據此而除外病毒感染；亦有在其他病毒感染（如肝炎、腮腺炎等）之後而發病。心髒受累症狀常在病毒感染前驅症狀出現1～3周後逐漸出現。
症狀多數患者症狀輕微而呈亞臨床型或隱匿型，僅有心電圖改變而疑及診斷，或因車禍死亡或死於其他疾病屍解時發現有心肌炎的病理改變。少數患者由於病變彌漫，出現大面積心肌壞死而呈暴發性發作，表現為急性心力衰竭、心源性休克或猝死。
在臨床就診的患者中，90%左右以心律失常為主訴或首發症狀，常訴有發熱、腹瀉或流感症狀，心悸、乏力、胸悶、頭暈等，嚴重者可出現暈厥或阿-斯綜合征。心髒擴大、心律失常或心力衰竭為心髒明顯受損的表現。部分患者可有程度不一的胸痛，其原因可能有：①伴發心包炎；②心肌壞死廣泛；③心排血量下降引起相對性冠狀動脈供血不足；④病毒感染引發閉塞性冠狀動脈炎。
