目前應根據病人病因、臨床、全身狀況、影像學所見及血液學檢查而選擇個體化的治療。現有的短暫性腦缺血發作的治療有以下幾種：
藥物治療 抗血小板凝聚劑，用於保護腦灌注、預防血栓。①阿斯匹林（Aspirin）腸溶片：首選藥物。推薦小劑量：75mg/d，以晚間10點左右服用為宜。應用小劑量阿司匹林可以抑制血小板環氧化酶，有效預防腦血栓形成，降低短暫性腦缺血發作復發，降低死亡率。小劑量阿司匹林可有效抗血小板聚集，又可減少副作用，有利於長期服用。如阿司匹林不能耐受或不能控制發作，則可選用氯吡格雷或培達。②氯吡格雷：50mg/d。作用和抵克力得相似，但不良反應較小，目前使用該藥物的最大障礙是價格昂貴。這三種抗血小板藥長期服用均可有出血的不良反應，應定期血常規監測。③西洛他唑（培達）：抗血小板聚集及擴張血管，一日二次，每次50~100mg口服。④潘生丁加阿司匹林：為唯一被批准的聯合用藥。
抗凝治療
可選用肝素，但應掌握適應症，治療過程中要監測凝血酶原時間，以防出血；低分子肝素不必監測凝血酶原時間，使用安全；華法令可預防非瓣膜疾患的房顫。
溶栓
靜脈給予tPA。適應症：①發病<1h。②頻發短暫性腦缺血發作。③實驗室檢查示血球容積、血小板、PT、KPTT均正常。
外科治療
頸動脈內膜剝脫術（CEA）和頸動脈成型術和支架放置（CAS）等。目前國外已開展得較多，但其遠期療效尚待觀察，而國內皆未形成規模，只有零散的經驗。
改善腦循環
可使用脈絡寧、復方丹參、川芍、紅花、葛根等中藥提取物，靜滴效果更好。
病因治療
對動脈硬化、高血壓、糖尿病、頸椎病、高黏血症、高脂血症等容易引起短暫性腦缺血發作發作的病症，應采取相應治療措施。
