目前，病毒性心肌炎的治療缺乏特異性。傳統治療主要包括休息，高蛋白質、高維生素飲食，提高機體免疫力，抗病毒，促進心肌營養和代謝，應用免疫抑制劑及免疫調節劑，以及抗心律失常等。
有學者嘗試應用黃芪、牛磺酸、鈣通道阻滯劑、血管緊張素轉換酶抑制劑、血管緊張素受體阻滯劑等藥物治療，也取得了一定療效。
一般而言，大多數患者經及時治療後，能完全康復，但也有部分患者可能遺留心律失常等後遺症。約12.5%的患者會進展為擴張型心肌病，極少數患者會因心肌彌漫性炎症、壞死，進而發生急性心力衰竭、心源性休克或嚴重心律失常而死亡。
可采用中西醫結合的方法，通過改善心肌組織局部微循環、防止心肌損傷、提高心肌活力、恢復心肌細胞功能，從而達到治療心肌炎的目的。
