母體因素：
1、母親懷孕早期患各類感染性疾病，尤其是病毒性感染，如風疹、水痘、流感、流行性腮腺炎等。
2、各種類型的糖尿病，尤其是在妊娠早期的胰島素依賴型病人。
3、結締組織疾病，如系統性紅斑性狼瘡，風濕性關節炎。
4、孕期接受某些藥物或毒物影響：常見有苯丙胺、化學物質锂、三甲雙酣、大倫丁、酒精、吸煙。
5、高齡孕婦及不正常妊娠史：孕婦年齡大於35歲，其胎兒染色體畸變的機率增高。
6、近親婚配：近親婚配是使胎兒致畸而發生先心病的高危因素。
胎兒因素：
1、常規產前超聲檢查發現胎兒心髒可疑異常。
2、常規檢查中發現以下器官的畸形，提示與先天性心髒病有較大關聯：
①、腦積水；
②、食道閉鎖、十二指腸閉鎖、空腸閉鎖；
③、臍膨出、胃腸膨出；
④、腎髒發育不全；
⑤、膈疝。
3、染色體異常：染色體異常的胎兒中，先天性心髒病的發病率以第21對染色體三體即先天性愚型最高為50%，其他有18對染色體三體畸形、Tuner‘s綜合征等。
4、胎兒心律失常：胎兒心律失常包括心動過緩，心動過速和心律不齊。以上三種情形均為胎兒超聲心動圖檢查的適應症。
5、胎兒水腫：非溶血等免疫問題引起的胎兒水腫可能因心髒畸形或心功能不全引起。
家族因素：
本病有遺傳因素存在。遺傳學的研究認為，多數的先心病是多個基因與環境因素相互作用所形成。
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