病毒感染心肌後擴張型心肌病的形成主要是自身免疫性的，自身抗原是交叉抗原或分子結構相似的產物。
實驗研究發現易感小鼠病毒滴度高、中和抗體產生遲、病毒消除慢；感染病毒的小鼠脾髒產生的毒性T細胞能溶解體外培養的心肌細胞；易感小鼠病毒性心肌炎後和擴張型心肌病患者有相同的特異性心肌蛋白抗體。
上述結果支持“自身免疫反應是病毒感染後擴張型心肌病的發病機制”這一觀點。但下列結果不支持這一觀點，如無胸腺小鼠仍能患心肌炎；嚴重免疫缺陷的小鼠可產生重症心肌炎；免疫抑制劑治療加劇心肌炎小鼠的病情。
這些具有陽性結果的相關研究形成了病毒性心肌炎後擴張型心肌病發病機制的新觀點。
該機制可解釋為什麼運動可加劇急性病毒性心肌炎的病情，說明病程早期心室功能受損的基礎是心肌頓抑，有利於探索新的影像學早期診斷手段，評估病毒性心肌炎的療效。根據該機制，認為早期應用擴血管藥物可能對擴張型心肌病有益。
