1、“先天性再生障礙性貧血”的病因，臨床多在10歲之內發病，多數有家族史，可能與胎兒時期受某些影響發育的因素有關。多發畸型、智力低下、發育停滯，約占2.5%。治療與後天獲得性再障相同
2、“後天獲得性再生障礙性貧血”，根據病因也可分為兩種。一種屬原因不明者，叫做“原發性再障”，約占70.3%。實際上這類再障的原因可能被忽視或尚未被認識。另一種屬能查明原因者，叫做“繼發性再障”，約占16.9%。隨著對病因的重視和深入的調查，逐漸發現更多的致病因素，因此繼發性再障已有明顯增加。 3、繼發性再障多數是物理，生物，化學等因素導致的再障，這與我們常說的食物中毒類似，當已經診斷後，查明的具體病因應該及時的進行治療，繼發性再障不同於原發性再障，治療起來相信要容易的多。
4、電離輻射可以導致再生障礙性貧血疾病，如X線、放射性同位素等這些都可以破壞細胞和蛋白質，導致骨髓細胞壞死，其中紅系細胞最敏感，粒系細胞次之，再次為巨核細胞系，對淋巴細胞也有溶解作用。電離輻射是再障病因之一，早已為廣大學者所認識。
5、藥物因素也可以引發再生障礙性貧血疾病，人們做好防范措施，長期使用激素類藥物，或劑量過大等原因所致，如：抗生素、如苯及衍生物甲苯等，這些藥物都有可能導致該病的發生。
6、生物因素是很多再生障礙性貧血患者的發病病因，病毒和細菌感染都能引起再生障礙性貧血的發生，其中以病毒性肝炎最為明顯，肝炎引起再障的機理，有的認為肝炎病毒對造血干細胞有直接作用，或用免疫機理解釋。
