心肌炎的病因分為3類
（一）感染性疾病病程中發生的心肌炎
其致病病原體可為細菌、病毒、霉菌、立克次體、螺旋體或寄生蟲。細菌感染以白喉為著，成為該病最嚴重的並發症之一；傷寒時心肌炎不少見；細菌感染時心肌受細菌毒素的損害。細菌性心內膜炎或心肌炎可以延及心肌，伴發心肌炎，致病菌以葡萄球菌、鏈球菌或肺炎球菌為主，腦膜炎球菌菌血症、膿毒血症等偶爾可侵犯心肌而引起炎症。多種霉菌如放線菌、白色念珠菌、曲菌、組織胞漿菌、隱球菌等都可引起心肌炎症，但均少見。
原蟲性心肌炎主要見於南美洲錐蟲病與弓青工體病。立克次體病如斑疹傷寒也可有心肌炎症。螺旋體感染中鉤端螺旋體病的心肌炎不少見，梅毒時心肌中可發生樹膠樣腫。近年來，病毒性心肌炎的發病率顯著增多，受到高度重視，是當前我國最常見的心肌炎，霉菌、寄生蟲、立克次體或螺旋體引起的心肌炎則遠比病毒和細菌性心肌炎少見。
（二）過敏或變態反應所致的心肌炎
就目前所知，風濕熱的發病以變態反應可能最大，風濕性心肌炎屬於此類。
（三）化學、物理或藥物所致的心肌炎
化學品或藥物如吐根素、三價銻、阿霉素等，或電解質平衡失調如缺鉀或鉀過多時，均可造成心肌損害，病理上有炎性變化；心髒區過度放射，也可引起類似的炎性變化。
這些因素會加重心肌炎
1、過度運動
運動可致病毒在心肌內繁殖復制加劇，加重心肌炎症和壞死。
2、細菌感染
細菌和病毒混合感染時，可能起協同致病作用。
真菌和原蟲這些病毒和細菌直接侵犯心肌，以及對心肌內小血管的損傷，免疫機制產生的心肌損傷和毒素對心肌的損害，造成心肌細胞的溶解，間質水腫，單核細胞浸潤。
從病理角度分析心肌炎原因，如進行病理學切片檢查，鏡檢可見心肌纖維之間與血管四周的結締組織中可有組織細胞、淋巴、嗜酸或中性粒細胞浸潤和間質水腫，心肌纖維可有脂性、顆粒性或玻璃樣變性，也可有心肌溶解或壞死。
3、妊娠
妊娠可以增強病毒在心肌內的繁殖，所謂圍產期心肌病可能是病毒感染所致。
4、其他
營養不良，高熱寒冷，缺氧、過度飲酒等，均可誘發病毒性心肌炎。引起心肌炎的原因很多，諸如病毒、細菌，真菌、寄生蟲、免疫反應，以及物理、化學因素等均可引起心肌發炎。
