手術治療
先心病一般是無法自行愈合的，均需通過手術或者介入的方法根治。但是對於缺損口徑小於0.5cm的室缺或房缺，可以無需治療，它不會對患兒心髒功能及生長發育產生不良影響。但由於孩子存在心髒雜音，對將來升學、就業、婚姻有一定影響，而現在手術又非常成熟，有些家長由於這些社會因素還是選擇手術。還有一些小的缺損，比如干下部位的室缺，由於靠近主動脈瓣，就是小於0.5cm，也需要積極手術治療。對於缺損口徑大於0.5cm的患兒建議行手術治療。
介入治療
介入治療主要用於先天性心髒病房間隔缺損、動脈導管未閉、肺動脈瓣狹窄、體動脈至肺動脈瘘和室間隔缺損等的根治性治療。對於一些暫時無法手術或是已喪失手術矯治時機的先天性心髒病經此方法治療後，可較好地等待手術矯治或是改善臨床症狀、延緩病情進展;此外還有一些手術矯治不徹底或不完全的先天性心髒病也可采用此方法進行補救性治療。如室間隔缺損、房間隔缺損手術後殘余漏、心髒瓣膜置換術後瓣周漏等，均可采用介入治療加以補救。
微創治療
心髒外科手術治療先天性心髒病的最傳統、最徹底、最經典方法是采取胸骨正中切口方式，此種先天性心髒病治療手術由於從胸骨正中作切口，將心髒全部暴露在視野內，幾乎適合所有的先天性心髒病類型。但是，這種先天性心髒病治療方法的缺點是手術中失血較多，且術後胸部會留下一條較長的疤痕，不僅影響美觀，對術後病人的心理創傷也較大。簡單的先天性心髒病病人，如動脈導管未閉、房間隔缺損、室間隔缺損和肺動脈瓣狹窄的病人，可以采用胸腔鏡輔助小切口房缺修補術、經胸微創房缺/室缺封堵術等先天性心髒病微創手術，達到減少創傷、美容、節約費用等好處。
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