室率控制2006年美國心髒病學會、美國心髒學會和歐洲心髒學會房顫指南指出，對於持續性或永久性房顫，常用β受體阻滯劑和非二氫吡啶類鈣通道阻滯劑控制室率（Ⅰ類）；藥物治療效果不佳或副作用嚴重時，可考慮房室結或旁道射頻消融治療以控制心室率（Ⅱa）；藥物不能控制心室率或懷疑心動過速性心肌病時，可考慮經導管射頻消融房室結（Ⅱb）。未經藥物治療的患者不考慮射頻消融房室結（Ⅲ）。
節律控制建議應用氟卡尼、多非利特、普羅帕酮、伊布利特（Ⅰ類）以及胺碘酮（Ⅱa）復律房顫。對於左房不大或輕度擴大的症狀性房顫患者，為預防房顫復發可以考慮射頻消融作為藥物治療的替代選擇（Ⅱa）。
藥物治療房顫警惕毒副作用
普羅帕酮有效轉復新近發生的房顫，對持續房顫、房撲、器質性心髒病療效較差，應避免用於器質性心髒病、心力衰竭、慢性阻塞性肺病患者。
奎尼丁有效轉復新近發生的房顫與持續性房顫。但副作用較多，包括扭轉性室速、惡心、腹瀉等。
胺碘酮治療房顫最為常用，具有抗交感和鈣通道阻滯作用，可轉復房顫、維持窦性心律、延緩房室傳導及有效控制心室率。器質性心髒病和心衰患者也可應用該藥。然而胺碘酮起效較慢，對多器官均有毒性作用，因而應用有限。
索他洛爾維持窦性節律作用欠佳，並具有致心動過緩、疲乏、支氣管痙攣和呼吸困難的不良作用，與其對β腎上腺素能的阻滯作用有關。尖端扭轉性室速發生率為2.4%，大多發生在起始治療後第1周或劑量調整後，女性患者中常見。因此，應當在具備心電圖監測和復蘇急救條件下，在院內進行初始索他洛爾治療。
華法林可有效降低血栓栓塞事件發生率，但諸多食物、藥物及遺傳等因素均可影響華法林療效，並且華法林治療譜窄，有出血風險，需在抗凝監測下調整劑量，導致很多房顫高危患者未接受抗凝治療或抗凝力度不足。
進展暫無突破性進展
新型Ⅲ類抗心律失常藥物盡管AFFIRM試驗結果顯示心律控制與室率控制效果相當，但恢復並維持窦性心律仍是理想治療終點。新型Ⅲ類抗心律失常藥物如多非利特和伊布利特等為這一終點的實現帶來一線希望。
非傳統抗心律失常藥物血管轉換酶抑制劑（ACEI）和血管緊張素受體拮抗劑（ARB）抑制心房重構、減少房顫發作的作用已得到重視。在2007年歐洲高血壓學會/歐洲心髒學會高血壓治療指南中，ARB和ACEI被推薦為高血壓伴房顫患者的首選降壓藥物。此外，他汀類藥物對房顫的作用也引起了關注。
Dabigatran該藥是一種新型口服直接凝血酶抑制劑，幾乎不存在與其他藥物和食物間的相互作用，可減少用藥後監測需求。
