先天性心髒病治療方法有兩種：手術治療與介入治療。
（1）手術治療為主要治療方式，實用於各種簡單先天性心髒病（如：室間隔缺損、房間隔缺損、動脈導管未閉等）及復雜先天性心髒病（如：合並肺動脈高壓的先心病、法樂氏四聯征以及其他有紫绀現象的心髒病）。
介入治療為近幾年發展起來的一種新型治療方法，主要適用於動脈導管未閉、房間隔缺損及部分室間隔缺損不合並其他需手術矯正的畸形患兒可考慮行介入治療。兩者的區別主要在於，手術治療適用范圍較廣，能根治各種簡單、復雜先天性心髒病，但有一定的創傷，術後恢復時間較長，少數病人可能出現心律失常、胸腔、心腔積液等並發症，還會留下手術疤痕影響美觀。而介入治療適用范圍較窄，價格較高，但無創傷，術後恢復快，無手術疤痕。
治療時醫生穿刺病人血管（一般采用大腿根部血管），通過特制的直徑為2—4毫米的鞘管，在X線和超聲的引導下，將大小合適的封堵器送至病變部位封堵缺損或未閉合的動脈導管，以達到治療目的。通過臨床實踐證實，先心病介入封堵具有創傷小、手術時間短（約1小時）、恢復快（術後第二天即可下床）、不需特殊麻醉及體外循環、住院周期短（約1周）等優點。只有當病人年齡小、不能配合手術者才需要全身麻醉。該封堵術的適應症很廣，房間隔缺損、動脈導管未閉、室間隔缺損均可以采用介入方法進行治療。介入治療先心病也有其局限性，不適合於已有右向左分流、嚴重肺動脈高壓、合並需要外科矯正的畸形、邊緣不佳的巨大缺損等。
關於先天性心髒病的介入治療
隨著病例的增加及經驗的積累，操作技術日益成熟，在大型醫療單位已成為治療先天性心髒病的常規方法。國內近50所醫院開展了此類手術。
動脈導管未閉
目前我國采用進口Ampatzer封堵器已完成動脈導管未閉封堵術2500余例，技術成功率98.4%。嚴重並發症發生率為1.6%（其中溶血1.36%，封堵器脫落0.2%，心包填塞0.04%），死亡率僅0.04%。
