從動物實驗、臨床與病毒學、病理觀察，發現有以下二種機理：
（一）病毒直接作用 實驗中將病毒注入血循環後可以心肌炎。以在急性期，主要在起病9天以內，病人或動物的心肌中可分離出病毒，病毒熒光抗體檢查結果陽性，或在電鏡檢查時發現病毒顆粒。病毒感染心肌細胞後產生溶細胞物質，使細胞溶解。 （二）免疫反應 實驗與人體病毒性心肌炎起病9天後心肌內已不能再找到病毒，但心肌炎變仍繼續；有些患者病毒感染的其他症狀輕微而心肌炎表現頗為嚴重；還有些患者心肌炎的症狀在病毒感染其他症狀開始一段時間以後方出現；有些患者的心肌中可能發現抗原抗體復合體。以上都提示免疫機制的存在。實驗中小鼠心肌細胞感染少量柯薩奇病毒，測得其細胞毒性不顯著；如加用同種免疫脾細胞，則細胞毒性增強；如預先用抗胸脾抗體及補體處理免疫脾細胞，則細胞毒性不增強；若預先以柯薩奇B抗體及補體處理免疫脾細胞，則細胞毒性增加；實驗說明病毒性心肌炎有細胞介導的免疫機制存在。研究還提示細胞毒性主要由T淋巴細胞所介導。臨床上，病毒性心肌炎遷延不愈者，E花環、淋巴細胞轉化率、補體C均較正常人為低，抗核抗體、抗心肌抗體、抗補體均較正常人的檢出率為高，說明病毒性心肌炎時免疫機能低下。最近發現病毒性心肌炎時自然殺傷細胞的活力與α干擾素也顯著低於正常，γ干擾素則高於正常，亦反映有細胞免疫失控。小鼠實驗性心肌炎給免疫抑制劑環孢霉素A後感染早期使病情加重和死亡率增高，感染1周後給藥則使死亡率降低。 引起心肌炎的13種病毒 （1）小核糖核酸病毒：腸道病毒如柯薩奇（Coxsackie），埃可（ECHO），脊髓灰質炎病毒，鼻病毒等； （2）蟲媒病毒：如黃熱病毒，登革熱病毒，白蛉熱病毒，流行性出血熱病毒等； （3）肝炎病毒：包括甲型，乙型，丙型和δ型肝炎病毒； （4）狂犬病病毒； （5）流感病毒； （6）副黏病毒：如流行性腮腺炎病毒，麻疹，呼吸合胞病毒等； （7）風疹病毒； （8）天花病毒； （9）疱疹病毒：如單純疱疹，水痘-帶狀疱疹，巨細胞病毒等； （10）腺病毒； （11）呼吸道腸道病毒； （12）腦心肌炎（encephalomyocarditis）病毒； （13）淋巴細胞脈絡叢腦膜炎病毒等，在上述諸多病毒中，以柯薩奇病毒B組1～5型（尤其3型最常見）和柯薩奇A組病毒中的1，4，9，16和23型病毒，柯薩奇病毒的B組為人體心肌炎的首位病原體，按其分型以2，4二組最多見，5，3，1型次之；A組的1，4，9，16，23各型易侵犯嬰兒，偶爾侵入成人心肌，埃可病毒中的6，11，12，16，19，22和25型病毒，流行性感冒病毒，流行性腮腺炎及脊髓灰質炎病毒最常見。
遠離心肌炎的方法
1、預防感冒感冒可以加重心肌炎的病情，還可以使已相對穩定的症狀再次復發，故心肌炎患者應注意避免傷風感冒。一旦患上感冒，也應及時治療，防止其對心肌的進一步侵犯。
2、適量休息，很多人把自己的工作看得很重要，主要目的是為了賺錢，如果這些人想預防心肌炎的話就需要適量休息，不要長時間地看書，也不要長時間地工作，也不要經常性地熬夜，要學會給自己放松。
3、膳食合理，合理的膳食在滿足身體對營養元素需求的同時還可以增強身體免疫力，也就是增強抵抗疾病的功效。如果大家想預防心肌炎的話就需要保證合理的膳食，多吃新鮮的蔬菜和水果，講究葷素搭配。
4、充分休息心肌炎患者應至少休息3～6個月，如果有心髒擴大的患者應至少休息半年以上，同時要限制體力活動。
5、定期復診對於慢性心肌炎患者應每隔一定時間到醫院復診，可復查心電圖、超聲心動圖等以了解疾病的發展情況，便於知道今後的治療。
6、加強營養心肌炎患者宜進食一些富含維生素的飲食，保證有足夠的蛋白質，以利於心肌的修復，促進病情恢復。
7、適量鍛煉，很多人為了增強身體抵抗力會經常性地進行體育鍛煉，而且是劇烈的體育鍛煉，這會增大患有心肌炎的幾率，如果想預防心肌炎的話就需要降低運動的頻率，簡單的運動就可以了。
8、配合治療心肌炎患者應以積極的心態配合醫生的治療，切不可采取悲觀消沉的態度。因為絕大多數心肌炎的預後良好，只要治療得當，不會遺留任何後遺症。患者要按時服藥，但也不要盲目濫用藥物，應遵照醫囑，合理用藥。
