高血壓並發症主要是大小血管的病變。心、腦、腎等器官是高血壓的損害對象，在醫學上被稱為高血壓的靶器官。
心：高血壓可以引起心肌肥厚及心力衰竭，還可以引起心絞痛及心肌梗死，長期的高血壓還會使心室擴張，形成高血壓心髒病。
腦：高血壓可以引起腦動脈硬化，最後引起中風，包括腦梗塞和腦溢血。
腎：高血壓可以引起腎動脈硬化，影響腎功能，甚至會導致尿毒症。
以上這些疾病，在早期可以沒有任何症狀。高血壓患者一旦出現這些靶器官的損害，即為高血壓三期。
產生這些並發症的原因：主要是由於高血壓使動脈產生了一系列變化，尤其是全身小動脈的長期痙攣，可能使血管壁發生營養不良性變化，內膜下蛋白性物質沉積，纖維組織增多，中膜肌層肥厚，動脈彈性減低，以致管腔變窄。由於小動脈內的變化，管腔內的沉積增厚變窄，醫學上稱此為“玻璃樣改變”。全各器官組織內的小動脈都會受到影響，其中尤以腎細小動脈最明顯。因為小動脈痙攣，血管外周阻力增加，心髒為了維持暢通的血液循環，必須加倍努力地收縮，才能使血液達到各處，其結果是心髒過於勞累，左心室肥厚以至擴張。腎髒則因腎小動脈硬化，形成腎缺血，最後產生高血壓素，促使全身小動脈痙攣，這樣又加重了高血壓，形成“惡性循環”。腎髒長期缺血，發生營養不良變化，腎功能也會受到影響。
