藥物過敏性心肌炎可通過心內膜活檢或屍檢進行病理診斷。早期臨床有藥物過敏表現，包括皮疹、高熱、高嗜酸性粒細胞血症、肝功能損害，同時有心髒受累的表現，如心動過速、心髒輕度擴大、心衰、心肌酶輕度升高、心電圖st—t改變，應高度懷疑藥物過敏性心肌炎。由於病理病變常彌漫分布，經靜脈右心室活檢常可獲得典型的組織學證據以幫助確診。本病臨床上與其他各型心肌炎相鑒別較困難，除臨床表現可提供鑒別診斷線索外，尚需要病理學證據。病毒性心肌炎也少有心肌壞死，病毒血清學試驗陽性，但無嗜酸性粒細胞浸潤。心髒寄生蟲感染和肉芽腫性病變也可有繼發性嗜酸性粒細胞浸潤，但常有灶性心肌壞死及心肌瘢痕形成。藥物中毒性心肌炎常有心肌壞死，並伴有多形核粒細胞和單核細胞炎性浸潤。
及時的診治直接影響預後，因此早期認識藥物過敏性心肌炎非常重要。對於臨床上有藥物過敏症狀和心肌炎症狀體征的患者，即使病情相對輕微或表現不明顯，也應警惕和重視。應詳細詢問患者用藥史，一旦被懷疑為藥物過敏性心肌炎，患者應首先停用所有可疑藥物，這不僅是有效的治療，也有助於驗證診斷。立即予以激素治療，如潑尼松30～60mg／天，在半年內逐漸減量，也可加用硫唑嘌呤(200mg／天)等免疫抑制劑治療，但即使予以積極治療，過敏現象仍可持續一段時間。既往認為激素僅用於出現嚴重心髒症狀時，最近認為在疾病的早期階段，就應該積極早期使用糖皮質激素或合用免疫抑制劑治療，有助於改善患者的存活率。本病具有潛在致死性，但如及時診斷和積極治療，大部分患者可在數日內康復，但部分未能及時診斷的患者也可能需要數周才能康復。
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